Ülke genelinde yaşayan nüfusun yüzde 85'i Hristiyan dinine inanır. Katolik mezhebine göre yaşamını sürdürenler yüzde 42 ile çoğunluktur. Yüzde 36'sı ise Anglikanizm inancına göre yaşar. Uganda'da çoğunluğu sünni mezhebinin oluşturduğu yüzde 12 civarında bir Müslüman topluluk yaşamaktadır. Afrika yerel dinlere inanların oranı ise yüzde 1’dir.
