Estonya15 ayrı yönetim birimine bölünmüştür. Bu bölgeler iktisadi ve coğrafi yapılarına göre birbirinden ayrılmaktadır. 15 ilçe, 183 kırsal belediye ve belediye statüsünde olmayan 8 şehir dâhil olmak üzere 30 şehirden oluşmaktadır. Ülkenin başkentiTallinn'dir. Önemli ve nüfus yoğunluğunun yüksek olduğu şehirleriyse başkent Tallinn'in yanı sıra Tartu, Narva ve Parnu'dur.
