Filipinler 80 idari bölüme, 120 şehre ve 17 bölgeye sahiptir. Fakat ülkeden bahsederken daha kolay olması açısından 3 büyük adası üzerinden gruplama yapılır. Bu adalardan ilki ülkenin başkentiManila’yı da kapsayan Luzon’dur. Filipinlerin en kuzeyinde kalan Luzon Adası hem ülkenin merkezi konumundadır hem de ekonomik açıdan en gelişmiş yeridir. İkinci ada Visayes ise Filipinler'in merkezindeki adadır. Doğası, biyolojik çeşitliliği ve antik dönemden kalma yapılarının yanı sıra ülkenin en güzel kumsalları da Visayes’dedir. Son olarak Mindanao Adası ise Filipinler'in en güneyindeki kısımdır. Yerli halk nüfusunun fazla olduğu Mindanao zengin bir kültüre sahiptir. Filipinler’in diğer önemli kentleri arasında UNESCO Dünya Mirası Listesi’ndeki Vigan, “Güney'in Kraliçesi” diye de andıkları ülkenin batısında kalan Cebu, kuzeydeki “Altın Dostlukların Kenti” Cagayan de Oro ve dünyanın en büyük kentlerinden aynı zamanda Filipinler'in en yüksek dağı Apo’yu da içine alan Davao vardır.
