Son 14.000 yılda çok çeşitli kültürlere ev sahipliği yapan Wisconsin Eyaleti’nin ilk yerleşimcileri Paleo-Kızılderililer olarak adlandırılırlar ve buzul çağındaki hayvanları avlamışlardır. Arkaik dönemdeki insanların balık tutma ve yabani bitkilerden besin toplama faaliyetleri ile beraber tarım da gelişmeye başlamıştır. Özellikle ormancılık döneminde tarım toplumları ortaya çıkmıştır. Burada yaşayan toplumlar eyalet etrafında binlerce höyük inşa etmişlerdir. 1000 ile 1500’lü yıllara gelindiğinde Mississippian ve Oneato kültürleri kendi yerleşim yerlerini inşa etmişlerdir. Avrupalılar ilk yerleşmeye başladıkları sırada bölgede hala yaşayan Amerikalı gruplar vardı. Ojibwa, Sauk, Fox, Pottawatomie bunlardan birkaçıdır. İlk olarak Fransızlar tarafından keşfedildikten sonra Yedi Yıl Savaşları döneminde İngilizlere devredilmiştir. İngiliz döneminde kürk ticaretiyle bölgenin ekonomisi yükseldi, kendi çiftliklerini kurup kendi kültürlerini, danslarını ortaya çıkardılar. İç savaş sırasında bölgede yaklaşık 91.000 asker birliği Wisconsin için savaşmıştır. Kölelik konusundan büyük ulusal tartışmalara ev sahipliği yapmış olması da ülkede için önemli bir noktadır. Eyaletin ilk adı Green Bay’dir ancak daha sonra yakınındaki Wisconsin Gölü’nden dolayı bu ismi almıştır. 1848 tarihinde ABD eyaletlerinden biri olarak ilan edilmiştir. En büyük ekonomik gelişim ise 1973 yılında ABD Merkez Bankası’nın Milwaukee şehrine açılmasıyla olmuştur.